دانلود پروژه تشخیص تومور در تصاویر سی تی اسکن کبد با Matlab

تشخیص تومور در تصاویر سی تی اسکن کبد

سلام دوستان
پروژه­ ی آماده ­ای که واستون گذاشتم مربوط به پروژه­ ی درس پردازش تصویر هستش که کارش تشخیص سرطان کبد هست.
البته این مقاله دو قسمتی بود، قسمت اول سگمنت کردن کبد و قسمت دوم تشخیص تومور. که قسمت اولش رو بنده انجام ندادم.
اول روی تصویر یه سری بهبود انجام میدیم :

  1. استفاده از Linear contrast stretching برای افزایش تفاوت بین بافت کبد و تومور.
  2. جمع تصویر با خودش. بعد از تقویت کنتراست تصویر، سطوح روشنایی بافت کبد بیشتر و بین 140 تا 160 هست، که بعد از جمع تصویر با خودش بیشتر بافت­های کبد به شکل سفید در میآن. بافت­های سرطانی هم تیره­ تر از بافت­های سالم ظاهر میشن.
  3. حذف نویز با استفاده از فیلتر گائوشین.

این تصویر مربوط به بعد از حذف نویز با فیلتر گائوشین هست( قسمتی که تومور دارد تیره تر از بافت کبد می باشد.)

مرحله بعدی تبدیل تصویر خاکستری، به تصویر باینری هست که استفاده از الگوریتم IsoData انجام شده که توضیحات مربوط به کد و نحوه انجام کار تو بخش الگوریتم ایزودیتا به صورت مفصل گفته شده. این تصویرم مربوط به خروجی این الگوریتم هستش.

مرحله ­ی بعدی حذف تومورهایی هست که به اشتباه به عنوان تومور تشخیص داده شده­اند. که تو این قسمت هم دو راه پیشنهاد داده شده که من یکی از روش­ها رو استفاده کردم، که به این صورت هست:
این کار را برای هر کدام از تومورها تکرار کنید:
1.یک تومور را انتخاب کرده، با استفاد از دستور BwLabel ، مساحت آن را محاسبه و یک دایره هم مساحت با تومور انتخاب شده ایجاد کنید. که یه سری توضیحات تکمیلی هم درمورد رسم دایره تو این بخش رسم دایره بر روی تصویر هست
2. دایره را آنقدر روی تومور حرکت دهید تا بیشترین اشتراک بدست آید.
3. اگر Circularity که طبق رابطه­ ی زیر بدست می­آد بیشتر از 85% باشد، تومور به درستی تشخیص داده شده است.

Circularity= area of intersection between blob and circle/ area of formed circle

خط 79 تا 87 اشتراک بین تومورو دایره رو حساب میکنه و خط 88 بیشترین اشتراک رو محاسبه کرده و خط بعدی نسبت مربوطه رو.
خروجی مرحله آخر

یک توضیح در رابطه با خوندن و نمایش تصویر سه بعدی سی تی اسکن با پسوند mha بدم که کار خوندن رو تابع mha_read_volume انجام میده و تابع slicer برای نمایش تصاویر سه بعدی هست که من توابع رو هم ضمیمه ی پروژه کردم اما چند تا تابع دیگه هم میتونه برای نمایش تصاویر با پسوند mha و پزشکی استفاده بشه که تو بخش دانلود تولباکس ها و کد های مفید و کاربردی متلب گذاشته شده.

لینک پروژه بعلاوه تصاویر و توابع مربوط به خواندن و نمایش تصاویر سه بعدی رو از لینک زیر می تونید دانلود کنید:

دانلود پروژه


درباره نویسنده

انجمن نوانديشان ، یک انجمن علمی، غیردولتی و مستقل است که در حوزه های علمی و تخصصی مختلف، فعالیت خود را از شهریور 1388 شروع کرد. این انجمن در راستای نیل به کمک در بهبود وضعيت علمي و پژوهشي و تحقيقاتي کشور ایجاد شده است و به دنبال فراهم کردن بستر ارتباطی مناسب میان متخصصین ایرانی جهت آشنایی با همدیگر و گسترش همکاریها و راه هاي رسيدن از علم به عمل است.

مطالب مرتبط

4 نظر

نظر بدهید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *